포도상구균 감염의 원인균은 미구균과(Micrococcaceae)의 포도상구균속(Staphylococcus)에 속합니다. 포도상구균은 응고효소(coagulase)의 존재 여부에 따라 응고효소 양성과 음성으로 나뉩니다. 알려진 27종의 포도상구균 중 14종이 사람의 피부에 서식합니다. 사람의 병리학에서 세 종, 즉 S. aureus(응고효소 양성), S. epidermidis, S. saprophytics(응고효소 음성)가 역할을 합니다. S. aureus는 사람에서 가장 흔히 병인으로 작용합니다.
임상적 진단은 대엽성 폐렴의 경우에만 신뢰할 수 있지만, 지역사회 획득 폐렴, 중이염, 부비동염의 경우 폐렴구균 병인일 확률은 60~80%입니다. 진단은 해당 생물 기질의 미생물학적 검사 결과를 통해서만 확진할 수 있습니다. 비염의 경우 콧물(도말), 중이염, 부비동염의 경우 화농성 삼출물, 폐렴의 경우 가래, 뇌수막염의 경우 뇌척수액 검사가 필요합니다.
폐렴구균(Streptococcus pneumonie)은 타원형 또는 피침형의 그람 양성 쌍구균으로, 다당류 피막으로 둘러싸여 있습니다. 연쇄상구균과(Streptococaceae)의 연쇄상구균속(Streptococcus)에 속합니다. 피막 항원의 구조에 따라 85가지 혈청형이 확인되었습니다. 주요 병원성 인자는 식세포작용을 억제하는 피막과 CRP와 반응하는 세포벽의 테이코산입니다.